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タイトル: Linking virus genomes with host taxonomy
著者: Mihara, Tomoko
Nishimura, Yosuke
Shimizu, Yugo
Nishiyama, Hiroki
Yoshikawa, Genki
Uehara, Hideya
Hingamp, Pascal
Goto, Susumu
Ogata, Hiroyuki  kyouindb  KAKEN_id  orcid https://orcid.org/0000-0001-6594-377X (unconfirmed)
著者名の別形: 五斗, 進
緒方, 博之
キーワード: indicator
stakeholder
megacity
co-design
co-production
bottom-up
anthropogenic impact
environmental threshold
発行日: 1-Mar-2016
出版者: MDPI AG
誌名: Viruses
巻: 8
号: 3
論文番号: 66
抄録: Environmental genomics can describe all forms of organisms—cellular and viral—present in a community. The analysis of such eco-systems biology data relies heavily on reference databases, e.g., taxonomy or gene function databases. Reference databases of symbiosis sensu lato, although essential for the analysis of organism interaction networks, are lacking. By mining existing databases and literature, we here provide a comprehensive and manually curated database of taxonomic links between viruses and their cellular hosts.
著作権等: © 2016 by the authors; licensee MDPI, Basel, Switzerland. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License (CC BY) which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
URI: http://hdl.handle.net/2433/214451
DOI(出版社版): 10.3390/v8030066
PubMed ID: 26938550
出現コレクション:学術雑誌掲載論文等

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