生体分子におけるレアイベントサンプリング : Onsager-Machlup 作用を用いた計算方法 (ランダム力学系理論とその応用)

Abstract

本稿では、生体分子におけるレアイベントの意義、Onsager-Machlup作用の定義と導出、それを用いたパスサンプリング手法、拡張アンサンブルや再重みつけ法との組み合わせなどについて解説する。また今後の展望についても述べる。

Here we describe the meaning of rare events for computational biophysics, and explain the definition and derivation of the Onsager-Machlup (OM) action, path sàmpling methods using the OM action, and how to combine the OM action method with extended ensemble methods and reweighting methods. Finally we describe the future prospects on the computational use of the OM action.