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タイトル: 多様な免疫背景を持つヒト集団におけるHIV-1適応進化動態 (第16回 生物数学の理論とその応用 -生命現象の定量的理解に向けて-)
著者: 高田, 徹  KAKEN_name
佐藤, 佳  KAKEN_name
岩見, 真吾  KAKEN_name
著者名の別形: Takada, Toru
Sato, Kei
Iwami, Shingo
発行日: Jul-2020
出版者: 京都大学数理解析研究所
誌名: 数理解析研究所講究録
巻: 2166
開始ページ: 59
終了ページ: 62
抄録: 世界中で流行しているHIV-1には多くのサブタイプが存在しており, 流行の半数を占めるサブタイプC(HIV-1C)は主にアフリカを中心に世界中で流行している. そのHIV-1Cのほとんどは, ウイルスが出芽の際に用いるYPモチーフ(ウイルスGagタンパク質のC末端に存在)を欠損していることが明らかとなった. HIV-lCの多くがYPモチーフを欠損している理由の一つとしては, アフリカ人特有のHLAからの免疫逃避による適応の結果, YPモチーフ欠損株がヒト集団内に侵入, 定着したということが考えられる. そこで, YPモチーフ特異的なHLAを持つヒトがどのくらい集団内に存在するとYPモチーフ欠損株が侵入, 定着できるのかを確認するために, ヒト集団を免疫背景によって区別する疫学モデルを開発し, 確率シミュレーションを行った. その結果, YPモチーフが集団内に侵人, 定着するために必要となるYPモチーフ特異的なHLAを持つヒトの集団内での頻度が明らかとなった.
URI: http://hdl.handle.net/2433/261497
出現コレクション:2166 第16回 生物数学の理論とその応用 -生命現象の定量的理解に向けて-

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